Juan Muñoz encabeza el trío de maestros que durante todo el siglo y en mandatos de larga duración sirvieron en la Catedral de Badajoz. Asumió el cargo de maestro de capilla en 1706, sucediendo a Miguel de Cañas.

Natural de la ciudad, músico tenor y ayudante del maestro Cañas en la catedral, desarrolló una gran actividad creadora de música litúrgica “a capella” y otras composiciones con acompañamiento de órgano y orquesta.

Durante sus años de magisterio, el coro ‘pacense’ (perteneciente a Badajoz) se enriqueció con nuevos instrumentos de cuerda y con la adquisición de un órgano monumental barroco, al mismo tiempo que conoció, en enero de 1729, la presencia de la Capilla Real dirigida por el italiano Felipe Falconi, que solemnizó los esponsales de la princesa María Bárbara de Braganza con el heredero de la corona española, el futuro Fernando VI.